Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc63Q8CDV6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms