Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8CC96 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8CC96 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8CC96 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8CC96 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8CC96 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8CC96 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8CC96 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8CC96 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8CC96 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8CC96 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8CC96 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8CC96 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8CC96 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8CC96 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8CC96 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8CC96 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8CC96 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8CC96 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8CC96 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8CC96 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8CC96 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8CC96 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8CC96 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CC96 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CC96 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CC96 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CC96 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CC96 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CC96 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CC96 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CC96 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms