Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slfn5Q8CBA2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms