Protein–RNA interactions for Protein: Q8CA03

Slc46a2, Thymic stromal cotransporter protein, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a2Q8CA03 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a2Q8CA03 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms