Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc113Q8C5T8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ccdc113Q8C5T8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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