Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp1Q8C4U3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms