Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg16l1Q8C0J2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg16l1Q8C0J2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms