Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim35Q8C006 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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