Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Iffo1Q8BXL9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms