Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trerf1Q8BXJ2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Trerf1Q8BXJ2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Trerf1Q8BXJ2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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