Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmod1Q8BVA4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmod1Q8BVA4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms