Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cxcl16Q8BSU2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Cxcl16Q8BSU2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Cxcl16Q8BSU2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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