Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSA9

Tyw3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyw3Q8BSA9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tyw3Q8BSA9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tyw3Q8BSA9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms