Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQU3

Sdhaf3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf3Q8BQU3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf3Q8BQU3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms