Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc2Q8BKV1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms