Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tspan12Q8BKT6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tspan12Q8BKT6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms