Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Best2Q8BGM5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Best2Q8BGM5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms