Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubash3bQ8BGG7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms