Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a9Q8BGD6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms