Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrtm2Q8BGA3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrtm2Q8BGA3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms