Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M10.2Q85ZW9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.2Q85ZW9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 395 ms