Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M10.6Q85ZW5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-M10.6Q85ZW5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M10.6Q85ZW5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms