Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc50Q810U5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms