Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc172Q810N9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms