Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cracr2bQ80ZJ8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms