Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD9

Amigo2, Amphoterin-induced protein 2, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo2Q80ZD9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Amigo2Q80ZD9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Amigo2Q80ZD9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Amigo2Q80ZD9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Amigo2Q80ZD9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Amigo2Q80ZD9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo2Q80ZD9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms