Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Amigo1Q80ZD8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Amigo1Q80ZD8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Amigo1Q80ZD8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Amigo1Q80ZD8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Amigo1Q80ZD8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Amigo1Q80ZD8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Amigo1Q80ZD8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Amigo1Q80ZD8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Amigo1Q80ZD8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Amigo1Q80ZD8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Amigo1Q80ZD8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Amigo1Q80ZD8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Amigo1Q80ZD8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Amigo1Q80ZD8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Amigo1Q80ZD8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Amigo1Q80ZD8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Amigo1Q80ZD8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Amigo1Q80ZD8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Amigo1Q80ZD8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Amigo1Q80ZD8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amigo1Q80ZD8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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