Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zbed4Q80WQ9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbed4Q80WQ9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms