Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pcsk9Q80W65 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms