Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ell3Q80VR2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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