Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims3Q80U57 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms