Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo2Q7TSY8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms