Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lamp3Q7TST5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lamp3Q7TST5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms