Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dsg1cQ7TSF0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms