Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prrc2bQ7TPM1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prrc2bQ7TPM1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms