Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Smap2Q7TN29 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smap2Q7TN29 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms