Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn4bQ7M729 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn4bQ7M729 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn4bQ7M729 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn4bQ7M729 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn4bQ7M729 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scn4bQ7M729 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Scn4bQ7M729 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn4bQ7M729 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn4bQ7M729 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn4bQ7M729 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn4bQ7M729 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn4bQ7M729 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn4bQ7M729 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Scn4bQ7M729 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn4bQ7M729 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn4bQ7M729 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn4bQ7M729 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn4bQ7M729 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Scn4bQ7M729 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn4bQ7M729 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Scn4bQ7M729 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Scn4bQ7M729 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Scn4bQ7M729 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Scn4bQ7M729 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Scn4bQ7M729 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Scn4bQ7M729 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn4bQ7M729 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Scn4bQ7M729 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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