Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TwistnbQ78WZ7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms