Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms