Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd4Q6ZPR5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms