Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms