Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gja6Q6S5G4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms