Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx4Q6RUU0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx4Q6RUU0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms