Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms