Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scaf4Q6PFF0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms