Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmeff1Q6PFE7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmeff1Q6PFE7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms