Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mfsd13aQ6PDE8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms