Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms