Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Herc4Q6PAV2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms