Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrig3Q6P1C6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrig3Q6P1C6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms